Nat Genet: 人类癌症之中病毒分布

2022-02-07 12:28 来源:安阳妇科医院

德国癌症深入研究里面心 Peter Lichter 团队最新深入研究探索了有机体癌症里面病原体的分布。同月《自然—遗传学》在线刊载了这一成果。

作为泛癌仅有序列分析的组织的一部分,该资料库收集了 38 个特性的 2658 例癌症比对的仅有序列和一部分转录仅有序列测序资料,深入研究执法人员来进行共识的方法,整合了 3 个独立资料库来进行有系统深入研究潜在的病原体病原体。在 382 个序列和 68 个转录组资料比较大都探测到了病原体实际上。深入研究发掘出,已知的与相关的病原体,如爱泼斯坦—拉尔病原体(EBV)、乙型肝炎病原体(HBV)和人瘤病原体(HPV)的检出率都很很低。

这项深入研究揭示了胸部癌里面 HPV 和马达遗传病的值得注意排他性以及 HPV 与 APOBEC 突变特征的相关性,这暗示抗病原体攻击能力下降是宫颈癌、膀胱癌和胸部癌的某种程度。对于 HBV、HPV16、HPV18 和腺相关病原体 2,病原体整合与序列拷贝数的局部变化有关。在 TERT 基因表达附近的整合与端粒酶的很低理解有关,从而明显激活了该的发育过程。不可逆逆转录病原体的很低理解与风湿热症状较好的生存期有关。

许多现代出附近:

Zapatka, M., Borozan, I., Brewer, D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https://doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.

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